Реферат: План научно-исследовательской работы на 2012 г. Учреждения Российской Академии наук Институт биоорганической химии им академиков М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова ран

Форма 4

«Утверждаю»

Вице-президент РАН

академик______________

« »____________2011 г.




Согласовано бюро Отделения РАН

Академик-секретарь ___________________________

(наименование отделения РАН)

академик______________________

« »______________2011 г.






План научно-исследовательской работы на 2012 г.

Учреждения Российской Академии наук Институт биоорганической химии им. академиков М.М.Шемякина и Ю.А.Овчинникова РАН



№ п/п

Индекс научного направления

ИБХ.

Наименование тем.

Номер государственной

регистрации переходящих тем. Научный руководитель темы

Источники

финансирования

Объем финансирования

(тыс. руб.)

Наименование этапов

исследований в 2012 г.

Подразделение

научной

организации РАН

Сроки начала и окончания

темы

Пункт Программы фундаментальных научных исследований государственных академий наук на 2008 -2012 гг.

1

2

3

4

5

6

7

1.

А. (9)


Новые белки - регуляторы раннего развития центральной нервной системы позвоночных.


Номер государственной

регистрации: 01201053941


д.б.н. А.Г.Зарайский

Базовое бюджетное финансирование


Программа фундаментальных исследований президиума РАН «Молекулярная и клеточная биология»


Гранты РФФИ



3000


650

(1) Роль секретируемого фактора Noggin4 в регуляции сигнальных каскадов Wnt и Activin/Nodal;

(2). Малая ГТФ-аза Ras-dva – регулятор обмена морфогенетическими сигналами в раннем эмбриогенезе.

(3). Белки сигнального каскада Shh, взаимодействующие с цитоскелетным белком Zyxin в раннем развитии нервной системы

^ Лаб. молекулярных основ эмбриогенеза

2010-2012 гг

42. Биология развития и эволюция живых систем


2.

А.

( 8)

Молекулярный дизайн и синтез низкомолекулярных биологически активных соединений и их аналогов.


Номер государственной

регистрации 01201053939

д.х.н. Формановский А.А.

Программа

фундаментальных исследований Президиума РАН №25

400

Поиск условий абиогенного синтеза аденозина и аденозинмонофосфата.


^ Лаборатория органического синтеза

2012

42.


3.

А. (8)

Разработка технологий получения трансгенных и нокаутных животных -биомоделей в соответствии с международными требованиями.


^ Номер государственной

регистрации 01201154251

к.б.н. Телегин Г.Б.

Базовое бюджетное финансирование





- Получение новой устойчивой линии генномодифицированных мышей с использованием стволовых мышиных клеток PRX-BALB/cJ #9(The Jackson Laboratory);

- сохранение уникальных генетических ресурсов НПП ПЛЖ путем криоконсервации.


^ НПП Питомник лабораторных животных ФИБХ

Январь 2009-декабрь 2012

42

4.

(6)

Исследование гомеотических генов, влияющих на морфологию соцветия сложноцветных на примере хризантем.

^ Номер государственной

регистрации 01201154258


к.б.н. Т.Ю.Митюшкина

Базовое бюджетное финансирование





Анализ уровня экспрессии генов MADS семейства в трансгенных линиях хризантем.

Оценка морфогенетических изменений в развитии цветка, бутона соцветия и растения в целом.


^ Станция искусственного климата «БИОТРОН» ФИБХ

2011-2012

42

5

А (10)

Структура низкомолекулярных компонентов природного гуминового комплекса, отвечающих за фотохимическую деградацию поллютантов в окружающей среде и фитогормональную активность.

^ Номер государственной

регистрации 01201154252

Научный рук. темы: Трубецкая О.Е.

Базовое

бюджетное финансирование


Грант РФФИ

10-05-00243-a;


Международный проект № 23962 по программе безвалютного обмена между CNRS (Франция) и РАН




Продолжение cтруктурного анализа желтого и голубого флюорофоров с помощью ЭПР и электрораспыли-тельной ионизационной масс-спектрометрии (ESI-MS). Определение скорости деградации триметилфенола и фурфурола в присутствии голубого и желтого флуорофоров при освещении растворов полихромати-ческим (300-500нм) светом.


^ Группа молекулярной экологии ФИБХ

2010-2012

43

6

(1, 5)

Иммуноактивные синтетические фрагменты эндогенных и экзогенных белков для иммунопрофилактики, лечения и диагностики.


^ Номер государственной

регистрации 01200957161


Научный руководитель темы Вольпина О.М.

Базовое

бюджетное финансирование


Программа фундаментальных исследований Президиума РАН


Гранты РФФИ


1582,8


120


600

Иммунопротективное действие фрагментов прионного белка в животной модели болезни Альцгеймера. Изучение активности противопептидных антител на культурах клеток, зараженных бета-амилоидом.

Изучение применения антител против нуклеофозмина и сурвивина для дифференциальной и уточняющей диагностики опухолевых заболеваний

^ Лаборатория синтетических вакцин

2009-2012

41,46 


7

(1), (8)

Структура, динамика, механизмы действия и биологическая функция мембранных и мембрано-активных белков и пептидов.


^ Номер государственной

регистрации 01200957167


Научный руководитель темы Д.х.н. Арсеньев А.С. Ответственный исполнитель д.б.н. Феофанов А.В.



А

Базовое

бюджетное финансирование



1242,7

Сравнительное исследование механизмов антимикробного действия латарцинов Ltc1 и Ltc5.

Изучение путей интернализации латарцинов Ltc1, Ltc3a и Ltc5 и идентификация клеточных структур, в которых происходит преимущественное накопление латарцинов в лейкоцитах и клетках HL60 - острого промиелоцитарного лейкоза человека.

Используя разработанную бактериальную клеточную тест-систему продолжить поиск и изучение новых пептидов-лигандов поровой части канала Kv1.3 в ядах скорпионов. Изучить особенности воздействия блокаторов Kv1.3 на клетки эукариот in vitro.

Разработка методик оптической микроскопии для детекции и изучения единичных молекул и единичных супрамолекулярных комплексов.

^ Отдел структурной биологии, Лаб. оптической микроскопии и спектроскопии биомолекул

2008-2012

46

8

(7)


Исследование функциональных свойств и оптимизация структуры конъюгатов хлорина е6 с наночастицами бора


^ Научный руководитель темы д.б.н. Феофанов А.В.



А

Базовое

бюджетное финансирование


Б. Научные и научно-технические исследования и разработки, финансируемые за счет внебюджетных источников.


РФФИ № 10-04-01436.



563,8


350

Изучение цитотоксичности в отсутствии активирующего воздействия и фотоиндуцированная цитотоксичность конъюгатов в отношении раковых клеток различного происхождения.

Анализ накопления и распределения конъюгатов в живых раковых клетках различного происхождения.

Агрегация/диссоциация и взаимодействие конъюгатов с биологическими молекулами в растворах.

Измерение квантового выхода генерации синглетного кислорода и относительной эффективности фотоиндуцированной генерации OH радикалов конъюгатами.

Анализ данных о клеточных структурах, преимущественно накапливающих исследуемые конъюгаты и данных о скорости накопления и времени удержания конъюгатов в раковых клетках различного происхождения.

^ Отдел структурной биологии, Лаб. оптической микроскопии и спектроскопии биомолекул

Январь-декабрь 2012

46

9

(1)

Структура, динамика, механизмы действия и биологическая функция мембранных и мембрано-активных белков и пептидов.


^ Номер государственной регистрации темы 01200957167


проф., дхн Арсеньев А.С.

А

Базовое

бюджетное финансирование.

Программа РАН: «Молекулярная и клеточная биология»

РФФИ: 09-04-00551а

(рук. Бочаров Э.В.)


РФФИ: 12-04-01816-а заявка

(рук. Бочаров Э.В.)


ГК_16.512.11.2172

(рук. Арсеньев А.С.)


РФФИ: 11-04-01795-а (рук. Бочарова О.В.)


РФФИ: 11-04-01822-а

РФФИ10-04-01752-a

(рук. Шенкарев З.О.)


РФФИ:11-03-00950-

(рук. Лесовой Д.М.)



Данные за 2011


3 400

390


2 400


300


350

Исследование пространственной структуры и внутримолекулярной динамики мембранных и мембрано-активных белков и пептидов в средах, имитирующих биологическую мембрану (мицеллах, бицеллах, нанодисках):

- гомо- и гетеродимеры трансмембранных доменов рецепторных протеинкиназ: ErbB-, EphA- и FGFR- семейств тирозинкиназ и их патогенных мутантов.

Исследования зависимости пространственной структуры и энергетики спираль-спирального взаимодействия в мембранных доменах рецепторов ErbB от наличия биологически-активных внутриклеточных примембранных регионов на примере трансмембранных доменов рецепторов EGFR, ErbB2.

Исследования энергетики взаимодействия между трансмембранными α-спиралями в мембранных доменах различных рецепторов семейства ErbB.

Получение структуры и определение динамических характеристик мутантных форм димера трансмембранного сегмента рецептора фактора роста фибробластов 3. Будет охарактеризован структурный механизм влияния патогенных мутаций в трансмембранном сегменте FGFR3tm на функционирование рецептора.

- трансмембранный домен белка амилоидного предшественника APP, ассоциированного с развитием болезни Альцгеймера;

- искусственные «пептиды-перехватчики», специфически взаимодействующие с α-спиральными ТМ доменами белков.

Изучение пространственной структуры G-белок-сопряженных рецепторов методом спектроскопии ЯМР.

-подбор условий рефолдинга бета-2-адренергического рецептора в мицеллах и нанодисках. Тестирование функциональнеой активности рецептора с помощью аффинной хроматографии. Ожидается получение функционально-активного рецептора. Получение изотопно-меченого бета-2-адренергического рецептора, встраивание его в нанодиски. Сравнение спектров ЯМР рецептора и бактериородопсина ESR в составе нанодисков.

- полноразмерные бактериородопсины (БР) из ^ Halobacterium salinarium (завершить отнесение сигналов полноразмерного бактериородопсина Halobacterim salinarium),

и Exiguobacterium sibiricum( получение 2H-13C-15N-меченого бактериородопсина психротолерантных бактерий E. sibiricum (ESR). Провести подбор условий для съемки ЯМР спектров ESR. Получение спектров ЯМР ESR в составе нанодисков и мицелл. Проведение структурных исследований ESR методами ЯМР и рентгеновской кристаллографии. Охарактеризовать <<предсвернутое/

расплавленное>> состояние мембранного белка на примере вольт-сенсорного домена канала KvAP в составе мицелл анионных детергентов.

Исследование механизмов формирования и поддержания пространственной структуры интегральных мембранных белков на примере бета2-адренорецептора из семейства рецепторов, сопряженных с G-белками.

Определение роли парных взаимодействий трансмембранных спиралей в механизмах формирования пространственной структуры мембранных белков, получение новых знаний о влиянии мембраномоделирующего окружения на механизмы <<спираль-спирального>> узнавания.

Получение изотопномеченых (13С) GPCR-белков. Разработка упрощённых процедур отнесения сигналов с использованием априорных данных о структуре пептида и экспериментальных 13С-химических сдвигах.

Исследование пространственной структуры, динамики и механизма действия антимикробных пептидов растительного и животного происхождения.

Продолжить проект построения структурно-динамических моделей белков высокой точности, используя белки, имеющие различные типы вторичной структуры, например, альфа-структурный белок - трансмембранный домен рецептора фактора роста фибробластов 3 человека (FGFR3tm), и природно неструктурированный белок ̶ - цитоплазматический домен альфа-цепи В-клеточного рецептора человека.

^ Отдел структурной биологии ИБХ РАН, лаборатория

биомолекулярной ЯМР спектроскопии

2008-2012

46

10

(1)

Антимикробные пептиды

природного происхождения (из бактерий, грибов, растений и животных): поиск, выделение, структурно-функциональное

исследование и изучение взаимодействия с мембранами.


Номер государственной регистрации: 01201053937


^ Научный руководитель Т.В.Овчинникова.

Базовое

бюджетное финансирование


ФЦП «Научные и научно-педагогичес-кие кадры иннова-ционной России на 2009-2013 годы»

Госконтракт П1159

от 03.06.2010 г.


Грант РФФИ

№ 12-04-01224-а «Исследование моле-кулярных факторов системы врожденного иммунитета растений»




Исследование антимикробных пептидов животного происхождения.

Получение штамм-продуцента рекомбинантного антимикробного пептида из лейкоцитов осетра Acipencer guldenstadti.

Изучение влияние ареницинов из морских полихет Arenicola marina на потенциал-зависимый транспорт протонов в реконструированных протеолипосомах.

Исследование антимикробных пептидов растительного происхождения.

Получение штамм-продуцента новой рекомбинантной изоформы LTP из чечевицы Lens culinaris, принадлежащего к классу PRP-14 растительных защитных белков.

Исследование антимикробных пептидов бактериального происхождния.

Получение штамм-продуцента рекомбинантного белка, включающего аминокислотную последовательность лантибиотика из термофильных бактерий Bасillus licheniformis.

Разработка эксперментальной тест-системы для характеристики мембранной активности анти-микробных пептидов на основе бислойных липидных мембран, моделирующих мембраны грамположительных и грамотрицательных бактерий, а также клеток млекопитающих.

^ Научно-образовательный центр ИБХ РАН

2010-2012 гг.

46


11

(1, 7).

Исследование терапевтического потенциала аналогов пептида дельта-сна в онкологии.

^ Номер государственной регистрации:

01201054505


Научный руководитель: Иванов В.Т.

А

Базовое

бюджетное финансирование




Продолжение изучения физиологической активности аналогов пептида дельта-сна


Продолжение работы по изучению структуры и биологической активности компонентов пептидных библиотек растений,


^ Лаборатория химии пептидов

2010-2012

46

12

(1)

Синтез и структурно-функциональные исследования иммуномодуляторов класса мурамилпептидов для разработки новых иммунобиологических препаратов для профилактики и иммунотерапии.


^ Номер государственной

регистрации 01201053931

Андронова Т.М.

Демушкин В.П.

Базовое

бюджетное финансирование




Изучение механизма действия

ГМДП.


Изучение механизмов мукоадъювантного действия низкомолекулярных хитозанов.


Продолжить работы по изучению структуры и биологической активности компонентов пептидных библиотек растений,


^ Лаборатория химии пептидов

2010-2012

46

13

(1)


Структурно-функциональное изучение флуоресцентных белков для разработки новых технологий флуоресцентного мечения в живых системах


^ Номер государственной

регистрации 01201053936


Лукьянов С.А.


Базовое

бюджетное финансирование

Программа Президиума РАН «Молекулярная и клеточная биология»

РФФИ 10-04-01042а

РФФИ 10-04-01561а

РФФИ 11-04-01427а

РФФИ 11-04-01293а

РФФИ 11-04-01861а

ФЦП "Кадры" П 256

ФЦП "Кадры" 16.740.11.0367




1 Структурно-функциональные исследования флуоресцентных белков.

2 Разработка и применение новых генетически кодируемых сенсоров.

3 Разработка технологий флуоресцентного мечения живых систем.


^ Лаборатория молекулярных технологий и Технопарк

Лаборатория биофотоники

Январь 2010 – декабрь 2012

46

14

(1)

Посттрансляционные модификации белков семейства GFP.

^ Номер государственной

регистрации: 01201053933


Мартынов В.И.

Базовое

бюджетное финансирование




Определение пространственной структуры желтого флуоресцентного белка phyYFP с помощью рентгеноструктурного анализа.

Группа химии хромопротеинов совместно с лабораторией рентгеноструктурного анализа

01.01.2010 - 31.12.2012

46

15

А. ( 1)

Исследование пространственной организации и структурно-функциональной взаимосвязи белков методами рентгеноструктурного анализа, биоинформатики, молекулярной механики/ динамики.


^ Номер госрегистрации:

01201053938

Научный руководитель:

дхн Плетнев В.З.

Базовое

бюджетное финансирование




Методом рентгеноструктурного анализа установить на атомном уровне и провести кристаллографическое уточнение пространственных структур супер дальнекрасных генно-инженерных вариантов красного флуоресцентного белка– eqFP650 и eqFP670. Установление взаимосвязи между пространственной организацией и фотофизическими характеристиками исследуемых объектов.

Лаборатория рентгено-структурного анализа

01.01.2010

-

31.12.2012

46

16

(1. и 4).

Исследование генома и протеома яда паукообразных и растений с целью идентификации новых биологически-активных веществ, взаимодействующих с клеточной мембраной.

^ Номер государственной

регистрации 01201053928

Научный руководитель темы

Член-корр. РАН Гришин Е.В.

Базовое

бюджетное

финансирование


Программа Президиума РАН,


Грант РФФИ


ФЦП Минобрнаука





Моделирование функциональной активности компонентов природных ядов и защитных пептидов растений.


^ Лаборатория нейрорецепторов и нейрорегуляторов

2010-2012 гг

46


17

(1).

Новые полипептиды животных ядов, действующие на Cys-петельные рецепторы и гемостаз.

^ Номер государственной

регистрации 01201053935.

Д.х.н. Ю.Н.Уткин

Базовое

бюджетное финансирование


Гранты РФФИ



800

Определение фармакологических свойств выделенных белков in vivo (токсичность и т.п.) и in vitro (модуляция нейрорецепторов и ионных каналов и др.).

^ Отдел молекулярных основ нейросигнализации

Лаборатория молекулярной токсинологии

2010-2012

46.


18

(1).

Создание новых лигандов Cys-петельных рецепторов на основе пептидных токсинов: конструирование, синтез, активность

^ Номер государственной

регистрации 01201054510

Д.х.н. И.Е. Кашеверов

Базовое

бюджетное финансирование


Гранты РФФИ



600

Определение активности и специфичности полученных пептидных соединений в тестах in vitro на некоторых Cys-петельных рецепторах и/или их гомологах.


^ Отдел молекулярных основ нейросигнализации

Лаборатория лиганд-рецепторных взаимодействий.

2010-2012

46.


19

(1).

^ Механизмы взаимодействия Cys-петельных рецепторов с природными и синтетическими токсинами.

Номер государственной

регистрации 01201054509

Член-корр. РАН, д.х.н. В.И.Цетлин

Базовое

бюджетное финансирование


Гранты РФФИ



900

Получение новых структур комплексов Cys-петельных рецепторов с некоторыми пептидно-белковыми токсинами и низко-молекулярными соединениями и сделать предположения о механизмах их взаимодействия с целью дальнейшего поиска и дизайна более эффективных лигандов.

^ Отдел молекулярных основ нейросигнализации

2010-2012

46.

20

(1) 

Тема – Исследование механизма действия биокатализаторов, ферментов, каталитических антител, компонент протеосомного комплекса.


^ Номер государственной

регистрации 01201054506


Руководитель темы

 Габибов А.Г.


Базовое

бюджетное финансирование


Гранты

NATO SfP 982833 - PRF,

программа “Нацтехбаза»

07-04-92168-НЦНИ_а

^ ICGEB CRP/RUS09-01

Программа Президиума РАН - «Фундаментальные науки – медицине»

Программа фундаментальных исследований Президиума РАН № 27 «Основы фундаментальных исследований

нанотехнологий и наноматериалов»



2000 тыс.руб.


2000 тыс.руб.


500 тыс.руб.


450 тыс.руб.


800 тыс.руб.


1500 тыс.руб

Исследование механизма действия протеосомного комплекаса и специфического процессинга аутоантигенов иммунопротеасомой.

 Исследование механизма действия протеаз патогенов и каталитических антител методом предстационарной кинетики

Исследование молекулярного механизма катализа деградации фосфорорганических молекул (пестицидов) рекомбинантными антителами.

Установление кроссреактивности антител в репертуаре больных РС нейроантигенов и вирусных белков.

Осуществление дизайна генно-инженерных цитотоксических агенов для специфической элиминации патологических В-клеток.


^ Лаборатория биокатализа

2010 - 2012

46.


21

(1)

Идентификация и структурно-функциональные исследования новых белков, участвующих в патогенезе ряда социально-значимых заболеваний. Разработка на их основе подходов для диагностики и лечения этих заболеваний.


^ Номер государственной

регистрации 01200957166


Научный руководитель темы:

Липкин В. М.

Член-корр. РАН



1. Базовое

бюджетное финансирование

2. Программа фундаментальных исследований Президиума РАН “Молекулярная и клеточная биология”



3. Грант РФФИ №11-04-00761а



4. Государственный контракт ГК № 16.512.11.2044





5. Государственный контракт ГК № 16.512.11.2036





1730000 руб


400000 руб


2180000 руб


1450000 руб



Исследование взаимодействия NDP-киназы А с DYNLRB1 в препаратах сетчатки быка, а также в клетках нейробластомы методом конфокальной микроскопии. Определение уровня фосфорилирования NDP-киназы А и DYNLRB1 при светозависимой активации фоторецепторных клеток.

Сравнительный электрофоретический анализ белков склеры миопических и нормальных глаз с последующим иммуноблотингом с использованием поликлональных антител против PEDF и металлопротеаз 2 и 9. Изучение влияния индуцированной миопии на экспрессию мРНК PEDF и металлопротеаз 2 и 9.

Используя стабильные гетерогенные клеточные линии с изменёнными уровнями экспрессии гапонина, обладающие различной устойчивостью к воздействию окислительного и метаболического стрессов, определить механизм участия гапонина в регуляции клеточного ответа на различные виды стрессовых воздействий и место данного белка в иерархии сигнальных каскадов клетки.

Получение специфических антител к rYM-1olf и анализ экспрессии белка в тканях воздухоносных путей в зависимости от микроокружения (от уровня экспрессии белка rSec14р и основного антиоксиданта тканей, контактирующих с кислородов воздуха, пероксиредоксина 6).

Изучение фармакокинетики пептида HLDF-6

Лаборатория белков гормональной регуляции

01.01.2009-31.12.2012



46

22



(1, 7, 8, 9, 10.)


Структура и функции белков ядрышек клеток млекопитающих.


Номер государственной

регистрации 01201053930


Зацепина О.В., д.б.н., профессор


Подтема:

6.5. (1.7) Структура и свойства нуклеофозмина в нормальных и малигнизированных клетках человека.


Подтема:

^ 6.5. (1) Функциональный анализ белка ядрышка SURF-6 в клетках млекопитающих.


Подтема:

6.8 (9) Ядрышко и ядрышковые белки в условиях стресса и митоза у млекопитающих.


Подтема:

^ 6.7 (7) Лабораторная модель склеродермии человека: иммуногистохимический анализ органов при аутоиммунных патологиях у

мышей.

Базовое

бюджетное финансирование


Грант Президиума РАН «Фундаментальные науки-медицине»,


Программа «У.М.Н.И.К.»,

ГК Министерства образования и науки РФ№ 14.740.11.0116,


ГК Министерства образования и науки РФ№ 14.740.11.0925,


ГК Министерства образования и науки РФ

№ 14.740.11.0116 и

№ 14.740.11.0925




700


600


800


400

Продолжение анализа нуклеофозмина в мозге, в первичных культурах клеток глии и нейронах.

Анализ нуклеофозмина в культурах клеток глиом и нейробластом человека.

Выявление белковых партнеров SURF-6 человека в живых клетках. Завершение изучения влияния сверхэкспресии SURF-6 в соматических клетках млекопитающих.

Продолжение изучения уровня экспрессии SURF-6 у больных лимфолейкозами.

Определение роли белка ядрышка фибрилларина в ответе клеток человека на окислительный стресс.

Сравнительный анализ поведения рРНК и белковых факторов процессинга рРНК при делении клеток млекопитающих.

Изучение локализация и стабильность рРНК на разных стадиях созревания ооцитов мыши.

Изучение биохимического состава ядрышковых телец в ооцитах млекопитающих с помощью витальных красителей.

Изучение способность аутоантител к ядрышковым антигенам проникать внутрь живых клеток и их возможная цитотоксичность эффекты на органном уровне.

Изучение реакции аутбредных мышей на регулярные инъекции сублетальных доз HgCl2.

^ Лаборатория структурной биохимии





46

23

(1)


Изучение структурно-функциональной организации и инженерия рекомбинантных белков для медицины и биотехнологии.


^ Номер государственной

регистрации 01201054508.


Руководитель темы – акад. М.П.Кирпичников


Базовое

бюджетное финансирование,


Программа Президиума РАН по молекулярной и клеточной биологии.

Программа Президиума РАН "Основы фундаментальных исследованй нанотехнологий и наноматериалов".

Грант РФФИ 11-04-01864-а.

Гос. Контракт № 16.740.11.0497.

Гос. Контракт № П-408.

Гос. Контракт № П-916 .






Разработка бесклеточных систем продукции фрагментов бета-адренергического рецептора человека.

Получение эффективного бактериального штамм-продуцента делеционного варианта интегрального мембранного белка BNIP3 и разработка метода выделения и очистки этого белка в количествах, достаточных для проведения структурных исследований методом ЯМР.

Разработка методов получения и очистки рекомбинантного трансформирующего фактора роста человека (TGFβ1).

Разработка и оптимизация системы экспрессии терапевтических антител против фактора некроза опухолей-альфа и интерферона-гамма в клеточных линиях СНО.

Исследование свойств ФНО-связывающих белков, полученных из библиотек ДНК на основе 10 домена фибронектина.

Проведение исследований мутантных вариантов цитохрома с, сконструированных на основе анализа информационной структуры белка с целью уменьшения конформационной подвижности участка 76-83 а.о., с помощью КД и Раман-спектроскопии.

Исследование активации CD4+ Т-клеток при нормальных и патологических значениях концентрации ионов кальция в периферической крови здоровых доноров.

Разработка флуоресцентного метода детекции взаимодействий эфринового рецептора EphA2 и рекомбинантного эфрина А1 на клеточной линии.

Разработка методов направленного поиска новых лигандов калиевых каналов семейства Kv1 на основе бактериальной клеточной тест-системы.

^ Отдел биоинженерии

2010-2012


46.

24

(5, 6)


Разработка фундаментальных принципов конструирования неприродных антител с заданными свойствами и нанокомплексов на их основе.


^ Номер государственной

регистрации 01201053929,


Руководитель: С.М. Деев

Базовое

бюджетное финансирование,

Программы Президиума РАН «МКБ», «Нанобио»,

гранты РФФИ
12-04-00757-а,

11-04-12091-офи-м-2011



7 000

1. Разработка универсальной технологии создания магнитоуправляемых мультифункциональных наночастиц с заранее заданными свойствами на основе белкового модуля барназа-барстар (продолжение исследования).

2. Разработка принципов конструирования гибридных биосовместимых наноконструкций для биоимиджинга - визуализации опухолевых клеток человека in vitro и in vivo на основе мини-антител и флуоресцентных наночастиц различной природы (наноалмазы, нанозолото и др.) (продолжение исследования).

3. Разработка принципов конструирования высокоэффективных иммунотоксинов на основе противораковых миниантител и действующих агентов различной природы (рибонуклеазы, бактериальные токсины, радионуклиды) (продолжение исследования).

4.Разработка принципов получения аналогов полноразмерных антител человека на основе моногенных рекомбинантных конструкций (продолжение исследования).

Лаборатория молекулярной иммунологии

2010-2012

46.

25

(1)

Протеомный анализ мха Physcomitrella patens.


Номер государственной регистрации – 01200957169


Д.б.н. Говорун В.М.

Базовое бюджетное финансирование





Анализ пептидома протонемы и

гаметофоров мха Physcomitrella

patens при тепловом стрессе.


Изучение протеомного профиля

митохондрий мха Physcomitrella

patens.


^ Лаборатория протеомики

2009-2012

46





(7).

Поиск пептидных маркеров рака яичника в сыворотке крови человека при помощи протеомных технологий.


^ Номер государственной

регистрации 01201054507


к.х.н. Р.Х.Зиганшин

Базовое бюджетное финансирование


Грант РФФИ № 09-04-12085-офи_м



1700

Идентификация пептидов сыворотки крови практически здоровых доноров и пациентов с различными, социально-значимыми заболеваниями человека

Выявление пептидных маркеров

рака яичников в сыворотке крови

человека.

^ Лаборатория протеомики


2009-12

46


26

( 1).


Структурно-функциональные исследования протеиназ, осуществляющих процессинг белков и регуляцию клеточных функций. Протеиназы социально опасных заболеваний.


Номер государственной регистрации - 01200957165


Румш Л.Д.


Базовое

бюджетное финансирование


грант РФФИ 11-04-00895


Госконтракт № 16.512.11.2110 от 25 февраля 2011


Грант РФФИ

10-04-01381-а





340


2 500


400

Продолжение структурно-функциональных исследований АТР-зависимых Lon-протеиназ – ключевых ферментов внутриклеточной селективной деградации белков на примере фермента из Escherichia coli (EcLon).

Продолжение работы по получению и исследованию укороченной формы фермента -психрофильной протеиназы из микроорганизма Serratia Proteamaculans (PSP). Изучение свойств фермента в комплексе с шаперонином.

Получение рекомбинантной цистеиновой протеиназы L и изучение ее свойств. IgA1 протеаза из Nesseria meningitidis (термостабильные протеиназы из кишечника личинок жука-кожееда Dermestes maculates).

Получение иммуноглобулина А1 человека в высокоочищенном состоянии. Наработка компонентов для окончательного варианта тест-системы для идентификации IgA1 антител на основе рекомбинантной IgA1 протеазы менингококка.

Продолжение работы по изучению протективной активности полученных образцов рекомбинантной IgA1 протеазы в опытах по заражению мышей культурой менингококков различных серогрупп. Изучение механизмов защиты от менингококковой инфекции животных, иммунизированных полученными препаратами.

Разработка подходов к идентификация дуоденазоподобных протеаз в тканях человека.

Теоретические исследования в области механизма действия протеиназ.

^ Лаборатория протеолитических ферментов

2010-2012

пункт 46

27

А (3)


Синтез и биологическая активность индолсодержащих липидов


Номер государственной

регистрации 01200957162


В.В. Безуглов

Базовое

бюджетное финансирование




1. Синтез индолсодержащих амидов простагландинов типов E и F как аналогов природных простамидов.
2. Определение возможного нейрозащитного действия синтезированных веществ в моделях, имитирующих нейродегенеративные процессы.

3. Определение цитото­ксического действия синтезированных веществ на культуре клеток глиомы С6.
4. Изучение гидролитической стабильности наиболее активных синтези­рованных соединений в биологических системах.

^ Лаборатория оксилипинов

2009-2012

46

28

(3,7)

Синтез новых противоопухолевых веществ липидной природы, создание и исследование форм их адресной доставки в опухоли.


^ Номер государственной

регистрации 01201053924


дхн Е.Л. Водовозова

Базовое

бюджетное финансирование


Грант

РФФИ




Синтез липофильных производных (ЛП) противоопухолевых лекарств, в том числе - флуоресцентно-меченых и липофильных гликоконъюгатов. Изучение внутриклеточного трафика лекарственных липосом. Изучение взаимодействия липосом с компонентами плазмы и крови. Исследования противоопухолевого эффекта адресных липосом с ЛП на различных моделях экспериментальных опухолей.

^ Лаборатория химии липидов

2010–2012 гг

46.


29

(3)

Синтез новых флуоресцентных

липидных зондов; изучение с их помощью строения и функций мембран.


Номер государственной

регистрации 01201053925


дхн Ю.Г.Молотковский

Базовое

бюджетное финансирование


Гранты

РФФИ




Синтез новых флуоресцентных зондов для исследования биологических и модельных

систем. Изучение строения и функций гликолипид-переносящего белка и его аналогов, а также церамидфосфат-переносящего белка.

Изучение структуры мембран, взаимодействий, латеральной диффузии ганглиозидов; изучение липид-липидных и липид-белковых взаимодействий в мембранных системах.

Исследование апоптотических процессов в клетках.

^ Лаборатория химии липидов

2010–2012 гг.

46.

30

(3, 4, 5, 7, 8, 9)


Гликоландшафт эукариотической клетки.


^ Номер государственной

регистрации 01201053926


д.х.н. Бовин Н.В.

Базовое

бюджетное финансирование


гранты РФФИ,

Программа Президиума РАН «Молекулярная и клеточная биология»,

Программа фундаментальных исследований Президиума РАН «Фундаментальные науки – медицине»,

Грант FP 6 Marie Curie




Синтез липофильных гликанов, способных количественно встраиваться в мембрану и дающих возможность управлять местоположением углеводного лиганда в составе гликокаликса. Разработка методологии встраивания этих гликолипидов и других проб в мембрану, а также методов изучения этих молекул и процессов, в которые они вовлечены.

Исследование репертуара, функции и медицинского потенциала (в диагностике и терапии) естественных антител к нормальным клеточным гликанам с помощью углеводных микрочипов

Исследования в области вируса гриппа, в том числе механизмов узнавания вирусом клеточных рецепторов.

Лаборатория химии углеводов

2010-2012

46



31

(7)

Исследование действия иммуносупрессоров на модели химически индуцированного аутоиммунитета.

^ Номер государственной

регистрации: 01200957173


к.б.н. Красильщикова М.С.

Базовое

бюджетное финансирование




Исследование эффектов известного иммуносупрессора циклоспорина А на течение индуцированного хлоридом ртути аутоиммунного процесса у аутбредных мышей.


Группа экспериментальной биологии с виварием

2009-2012

46

32

(1)


Рецептор IRR как сенсор щелочного рН в организме


^ Номер государственной

регистрации 01201054512


Д.б.н. Петренко